Kode CU · 21 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Cepu dilalui 21 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Airlangga | #79 | 19:41 | 19:45 |
| Aksa Cargo | #84 | 15:40 | 16:05 |
| Ambarawa Ekspres | #18 | 08:17 | 08:20 |
| Argo Anjasmoro | #18 | 13:46 | 13:49 |
| Banteng Cargo | #83 | 18:01 | 18:30 |
| Blambangan Ekspres | #79 | 20:12 | 20:15 |
| Blora Jaya | #1 | — | 05:15 |
| Commuter Line Blorasura | #1 | — | 04:40 |
| Dharmawangsa Ekspres | #79 | 17:39 | 17:42 |
| Gumarang | #18 | 17:00 | 17:03 |
| Harina | #62 | 06:26 | 06:31 |
| Kalimas Cargo | #20 | 03:30 | 03:50 |
| Kalingga Cargo | #84 | 12:23 | 12:38 |
| Kalmas | #65 | 13:07 | 13:20 |
| Kertajaya | #79 | 23:16 | 23:19 |
| Limasdan Cargo | #20 | 01:25 | 01:40 |
| Massao Cargo | #20 | 08:04 | 08:40 |
| Parcel Utara | #83 | 06:40 | 07:11 |
| Priukmas Cargo | #20 | 00:51 | 01:13 |
| Sancaka Utara | #18 | 09:05 | 09:08 |
| Sembrani | #18 | 09:29 | 09:31 |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.