33 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Cirebon dilalui 33 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Argo Anjasmoro | #61 | 18:16 | 18:35 |
| Argo Bromo Anggrek | #37 | 10:43 | 10:46 |
| Argo Dwipangga | #37 | 11:13 | 11:16 |
| Argo Lawu | #52 | 12:55 | 12:58 |
| Argo Merbabu | #27 | 08:24 | 08:29 |
| Argo Muria | #37 | 09:48 | 09:53 |
| Argo Semeru | #37 | 08:49 | 08:54 |
| Argo Sindoro | #27 | 09:29 | 09:34 |
| Bangunkarta | #75 | 15:24 | 15:30 |
| Batavia | #37 | 12:34 | 12:39 |
| Bima | #37 | 19:29 | 19:34 |
| Blambangan Ekspres | #36 | 15:05 | 15:10 |
| Brawijaya | #37 | 18:21 | 18:26 |
| Cakrabuana | #17 | 07:27 | 07:33 |
| Cheribon Fakultatif | #1 | — | 20:30 |
| Ciremai | #27 | 11:10 | 11:15 |
| Fajar Utama Solo | #36 | 08:27 | 08:31 |
| Fajar Utama Yk | #42 | 11:31 | 11:36 |
| Gajayana | #97 | 00:23 | 00:28 |
| Gumarang | #61 | 22:14 | 22:19 |
| Gunungjati | #1 | — | 05:35 |
| Harina | #19 | 01:40 | 01:45 |
| Jayakarta | #87 | 23:13 | 23:22 |
| Madiun Jaya | #65 | 14:07 | 14:12 |
| Manahan | #52 | 14:43 | 14:50 |
| Mataram | #52 | 13:45 | 13:51 |
| Sawunggalih | #34 | 10:02 | 10:07 |
| Sembrani | #61 | 13:38 | 13:43 |
| Senja Utama Solo | #52 | 00:01 | 00:05 |
| Senja Utama Yk | #42 | 21:45 | 21:50 |
| Singasari | #86 | 02:13 | 02:18 |
| Taksaka | #42 | 11:04 | 11:09 |
| Tawangjaya Premium | #36 | 09:24 | 09:29 |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.