Kode LPN · 18 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Lempuyangan dilalui 18 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Batavia | #79 | — | 17:11 |
| Bengawan | #78 | 17:10 | 17:18 |
| Bogowonto | #1 | — | 08:15 |
| Bungtalun Service | #10 | 01:21 | 02:25 |
| Commuter Line Yogyakarta | #12 | 06:19 | 06:20 |
| Gajahwong | #78 | 15:50 | — |
| Gayabaru Malam Selatan | #45 | 11:05 | 11:12 |
| Jaka Tingkir | #78 | 19:03 | 19:08 |
| Jayakarta | #45 | 18:27 | 18:31 |
| Kahuripan | #44 | 23:54 | 00:00 |
| Kalem Service | #1 | — | 03:10 |
| Karsolo Service | #29 | 11:19 | 11:37 |
| Parcel Selatan | #62 | 02:27 | 03:00 |
| Parcel Tengah | #55 | 00:39 | 00:54 |
| Pasundan | #45 | 09:49 | 10:06 |
| Progo | #1 | — | 13:10 |
| Singasari | #44 | 21:34 | 21:39 |
| Sri Tanjung | #1 | — | 07:00 |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.