3 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Merapi dilalui 3 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Baramerapi | #22 | 06:35 | — |
| Baraserdang | #2 | 01:26 | 01:47 |
| Simpangrapi | #1 | — | 00:45 |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.